Turneringen havde deltagelse af ti hold, der først spillede et grundspil i form af en firedobbelt-turnering alle-mod-alle, hvilket gav 36 kampe til hvert hold. Derefter gik de otte bedste hold videre til mellemspillet bestående af to kvartfinalepuljer med fire hold i hver, som hver spillede en dobbeltturnering. De to bedste hold i hver kvartfinalepulje gik videre til slutspillet om DM-medaljer, der blev afviklet som en cupturnering. Semifinalerne og finalen blev spillet bedst af fem kampe, mens bronzekampen blev afviklet bedst af tre kampe.
De ti hold spillede en firedobbelt-turnering alle-mod-alle, hvilket gav 36 kampe til hvert hold, som blev afviklet i perioden 18. september1999 - 20. februar2000. Efter uafgjorte kampe blev der spillet forlænget spilletid. Sejre (uanset om den blev opnået i ordinær eller forlænget spilletid) gav 2 point. Uafgjorte kampe og nederlag i forlænget spilletid gav 1 point, mens nederlag i ordinær tid gav 0 point.
K: Spillede kampe, V: Kampe vundet i ordinær spilletid (2 point), VO: Kampe vundet efter overtid (2 point), U: Uafgjorte kampe (1 point), TO: Kampe tabt efter overtid (1 point), T: Kampe tabt i ordinær spilletid (0 point), Mf: Mål for, Mi: Mål imod, +/-: Måldifference, P: Point
De otte bedste hold i grundspillet gik videre til kvartfinalerne, hvor de otte hold blev inddelt i to puljer med fire hold i hver. Holdene, der sluttede grundspillet som nr. 1, 4, 5 eller 8 udgjorde pulje A, mens pulje B bestod af de sidste fire hold. Hver pulje spillede en dobbeltturnering alle-mod-alle, og de to bedste hold i hver pulje gik videre til semifinalerne. Kampene blev spillet i perioden 24. februar - 7. marts2000.
Holdene, der sluttede grundspillet som nr. 1 eller 2 startede kvartfinalepuljerne med 2 point, mens holdene, der blev nr 3 eller 4 i grundspillet, begyndte med 1 point på kontoen. De resterende fire hold tog ingen point med fra grundspillet.
Slutspillet havde deltagelse af de fire hold, som var sluttet blandt de to bedste i deres kvartfinalepulje. Semifinalerne og finalen blev spillet bedst af fem kampe, mens bronzekampen blev spillet bedst af tre kampe.
Bronzekampen havde deltagelse af de to tabere af semifinalerne, Esbjerg IK og Odense IK. Opgøret blev afgjort bedst af tre kampe, og Esbjerg IK havde fordel af hjemmebane i en evt. tredje kamp som følge af at holdet var sluttet foran fynboerne i grundspillet, men så langt nåede serien aldrig, eftersom Esbjerg IK afgjorde serien med sejre i de to første kampe.
Finalen var et opgør mellem vinderen af Eliteseriens grundspil, Frederikshavn IK, og Herning Blue Fox, som var blevet nr. 3 i grundspillet, men som havde vundet sin kvartfinalepulje foran grundspillets nr. 2, Esbjerg IK. Opgøret blev spillet bedst af fem kampe, og der blev brug for alle fem kampe for at opnå en afgørelse om mesterskabet. Den afgørende finalekamp blev spillet i Frederikshavn Isstadion den 30. marts2000, hvor hjemmeholdet sikrede sig titlen med en sejr på 7-6 efter forlænget spilletid. Kampen blev afgjort blot 17 sekunder før udløbet af forlænget spilletid, hvor Ilja Dubkov scorede det afgørende mål, og dermed undgik man en afgørelse på straffeslag.
